Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
USF2Q15853 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
USF2Q15853 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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