Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA2Q15822 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms