Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDK5R1Q15078 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms