Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NCAPHQ15003 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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