Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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