Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTAN1Q13813 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms