Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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SHROOM2Q13796 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
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