Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCOA4Q13772 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCOA4Q13772 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms