Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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