Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGB3BPQ13352 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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ITGB3BPQ13352 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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