Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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