Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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