Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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TRAF1Q13077 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF1Q13077 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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TRAF1Q13077 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TRAF1Q13077 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF1Q13077 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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