Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC20Q12834 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms