Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TWF1Q12792 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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