Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYCNQ0VAF6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms