Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FAM27E3Q08E93 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FAM27E3Q08E93 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FAM27E3Q08E93 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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