Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACSM1Q08AH1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms