Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYP4F3Q08477 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms