Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF4Q08170 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SRSF4Q08170 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms