Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL9Q07325 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL9Q07325 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms