Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PAX8Q06710 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms