Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN1Q05586 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms