Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DSC2Q02487 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms