Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYP27A1Q02318 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP27A1Q02318 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms