Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms