Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK5Q00535 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms