Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRB1P82279 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRB1P82279 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms