Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RPS29P62273 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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