Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NME5P56597 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NME5P56597 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NME5P56597 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms