Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA1P56159 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms