Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DAP3P51398 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DAP3P51398 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DAP3P51398 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms