Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP4P49662 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP4P49662 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms