Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRPC1P48995 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms