Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CDKN1BP46527 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms