Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RECQLP46063 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RECQLP46063 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms