Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRATP43155 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRATP43155 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRATP43155 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms