Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGER3P43115 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms