Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBRP36941 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms