Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD13P35453 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms