Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNB1P35222 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNB1P35222 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms