Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms