Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA5P31644 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms