Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC13P31276 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms