Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXA13P31271 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms