Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CD34P28906 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD34P28906 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CD34P28906 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD34P28906 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms