Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE4AP27815 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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