Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms