Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRDP23468 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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