Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNB1P20700 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms